Багатоклітинні паразити. Багатоклітинні паразити, які використовують організм раків як проміжних господарів, діляться на трематод (сосальщиков), цестод (стрічкових черв'яків) і нематод (круглих черв'яків). Ці гельмінти - бич для хребетних, проте для безхребетних, зокрема раків, службовців інкубатором для проміжних стадій цих паразитів, це теж є проблемою.
Трематоди. Клас трематод, або сосальщиков. По крайней мере, представники 10-ти родин цих паразитів використовують раків як проміжних господарів. Крім раків, трематоди впроваджуються в організми равликів, двостулкових молюсків, з якими і можуть потрапити в акваріум. Вони впроваджуються в різних ділянках тіла для дозрівання або відкладання яєць і зазвичай не становлять загрози для життя раків. Однак при надмірній популяції в життєво важливих органах можуть викликати смерть. Ще не знайдено ефективного антипаразитарного засоби проти трематод, яке могло б з успіхом застосовуватися для лікування безхребетних в акваріумі.
Цестоди - захворювання цестодози. Збудниками є дрібні паразитуючі черви, яких називають гельмінтами або глисти. Гельмінти відносяться класу плоских стрічкових черв'яків, життєвий цикл можливий тільки при наявності теплокровного "донора". Ці паразити живуть в кишечнику кінцевих господарів - хребетних. Безхребетних ж, зокрема раків, використовують як проміжних господарів, і обгрунтовуються в тканинах і порожнинах організму, викликаючи захворювання, яке називається цестодоз. Якщо Ви придбали інфікованих гельмінтами раків, то це не кінець світу. Через брак кінцевих господарів в акваріумі цестоди пропадуть, не закінчивши свій життєвий цикл в організмі хребетного представника фауни, при цьому не викликавши передчасну смерть свого господаря-носія.
Нематоди. Нематоди - це круглі черв'яки, що налічують безліч сімейств і видів. Бувають як внутрішніми, так і зовнішніми, які вільно рухаються паразитами, які обирають раків не тільки як проміжних, а й як кінцевих власників. Найчастіше вони облюбовують зяброві камери. Була помічена залежність поширення вільно живуть нематод від органічної забрудненості води і температури. Експериментально було доведено ефективність антипаразитарного препарату "Baycox (toltrazuril)" проти зовнішніх нематод дозуванням 5 мкг / мл. У такому розчині все черви загинули протягом 24 годин. Якщо в акваріумі є рибки, проблема з нематодами може вирішитися самостійно, так як нематоди навіть спеціально вирощуються для корму риб. Внутрішні нематоди використовують раків як проміжних господарів. Інкапсульованих гельмінтів можна виявити в кишкових стінках або в поперечно-смугастих м'язах карапакса. Через брак кінцевих хазяїв "невилуплених" черв'яки загинуть свого часу разом зі своїми господарями.
Акантоцефалів (скребни). Зараження акантоцефалів (колючеголовие паразитичними черв'яками) було зареєстровано серед австралійських раків. Від інших гельмінтів акантоцефал легко відрізнити по вигнутому хоботка. Обгрунтовуються паразити в середній кишці, м'язах, кровоносній системі та інших місцях. Зараження в основному відбувається в дикій природі, коли інфіковані гельмінтами хребетні тварини, в кишечнику яких живуть акантоцефалів, з фекаліями поширюють личинки паразитів. Ці личинки і з'їдаються раками та іншими безхребетними. В акваріумі через брак кінцевого господаря для завершення життєвого циклу скребни вмирають разом з носять їх раками свого часу. Протипаразитарні засоби є, але точні дозування і методики використання їх не встановлені.
Ектокоменсали або ектосімбіонти. Дані види паразитів "засмічують" поверхню панцира або зябра раків. Прикрепившись до екзоскелет, вони харчуються бактеріями, що знаходяться у воді акваріума. Помічено прямий зв'язок між наявністю бактерій і даних видів паразитів в акваріумі. Отже, щоб уникнути поширення їх в акваріумі необхідно підтримувати органічну чистоту: чи не перегодовувати раків, підміни води здійснювати регулярно. 
Epistylis - стебельчатие найпростіші, харчуються бактеріями у воді і використовують поверхню тіла раку як підкладку. Epistylis небезпечний тим, що коли вони розростаються на зябрах, рак гине від задухи. З боку заражений рак виглядає як оповитий сіро-білого або коричневого піною. Небезпека цієї хвороби полягає в тому, що коли Epistylis сильно розростається на зябрах тварини, то перекриває йому достатній доступ кисню для дихання, що викликає задуху і подальшу смерть. Присутність даних паразитів говорить про несприятливу екологічну ситуацію в акваріумі: високою органічної навантаженні, низький рівень кисню і погану якість води.
Головною профілактичним заходом є придбання раків у відомих заводчиків. У будь-якому випадку знову придбаних раків необхідно витримати 3-4 тижні в карантинному акваріумі, стежачи за станом їх здоров'я. При виявленні інфікування у містяться в загальному акваріумі раків необхідно знизити бактеріальну і органічну забрудненість води, зменшити кількість корму. Хвороба не носить епідеміологічний характер, тому заражених акваріумних раків, рекомендується відселити в карантинні ємності. При поліпшенні екологічної обстановки після першої линьки раки можуть позбутися даного паразита.
Temnocephala - дрібні (0,4-14 мм) війчасті плоскі черви, що паразитують на поверхні тіла раків і відкладають яйця на зябрах і під черевцем тварини. Дорослі особини "бродять" по тілу господаря, харчуючись водоростями і іншими представниками мікрофауни акваріума. Їх легко розпізнати і без мікроскопа: Мають овальну або еліптичну форму, на їх тілі видно щупальця на передній і присоски на задній частині. Темноцефали харчуються водоростями і представниками мікрофауни.
Потрапляють до ракоподібних вони в основному через їхнє улюблене блюдо - равликів, які так само, як і раки є проміжними "господарями" в довгій харчовому ланцюжку тварин. Кінцевим пунктом черв'яків Temnocephalan є теплокровні тварини. Temnocephala не уявляють такої небезпеки для життя раків, як Epistylis. Проте, їх наявність говорить про погану якість води: великий концентрації органіки і нестачі кисню. Крім того в місцях кріплення яєць темноцефал накопичується детрит, що може привести до бактеріального зараження. Від них можна позбутися за допомогою сольових ванн (не більше півтора відсотка вмісту солі).
Паразити (п'явки Branchiobdella sp.), Дрібні (1-2 мм, біло-жовтуваті), які постійно мешкають на покривах раків, особливо на зябрах. Для позбавлення від паразитів раків влаштовують солоні ванни (1,5% солі).
