- Рак грудей і яєчників
- Предиспозицию до раку
- Сімейний аденоматозний поліпоз
- Синдром Лінча / Гередітарний неполіпозний колоректальний рак (HNPCC)
- Нестабільність мікросателітів - MSI
- Поліпоз, пов'язаний з MUTYH (MAP)
- Дефіцит тіопурин-S-метилтрансфераза - TPMT
- секвенування екзома
Ми співпрацюємо з компанією Asper Biotech, яка проводить генетичні аналізи в разі колоректального раку, раку грудей і яєчників, раку легенів, гліобластоми, а також в разі асоціативних з раком симптомів.
Ми пропонуємо зробити тести швидко, щоб діагноз і ризик захворювання був визначений як можна раніше. Рання діагностика раку важлива, щоб поліпшити результат лікування і продовжити життя.
Основний метод грунтується на визначенні секвенції або послідовності, в тому числі секвенування нового покоління, яке мутації хвороби і зміни в генах дозволяють визначити точно і з високим рівнем достовірності.
В особливих випадках використовуються тести, засновані на методах APEX (arrayed-primer extension) та MLPA (multiplex ligation-dependent probe amplification).
Доступні наступні тести:
- Аналіз мутації гена BRAF
- Визначення предиспозиции до раку грудей і яєчників
- Визначення сімейного аденоматозного поліпозу (FAP)
- Визначення синдрому Лінча / спадкового раку товстої кишки без поліпозу (HNPCC)
- Визначення синдрому Лінча і синдрому поліпозу
- Визначення нестабільності мікросателітів (MSI)
- MUTYH - визначення асоціативного поліпозу (MAP)
- Визначення дефіциту тіопурин-S-метилтрансфераза (TPMT)
- секвенування екзома
Аналіз мутації гена BRAF
Ген BRAF кодує серин / треонін-кіназ, який функціонує через Ras-Raf-MEK-MAPK, який з'єднує екстрацелюлярний сигнали з шляхом регуляції транскрипції. Активовані мутації BRAF знаходять у випадках колоректального раку, меланоми, раку яєчників, раку легенів і щитовидної залози. Найчастіша мутація BRAF - це c.1799T> A (V600E); ця мутація створює предиспозицию до інгібіції апоптозу, збільшує інвазивність пухлини і зустрічається під час карциногенезу.
Показання для аналізу цієї мутації:
1) Визначення мутації BRAF можна використовувати, щоб ідентифікувати випадки спорадичні MSI-H (висока нестабільність мікросателітів) колоректального раку, таким чином, виключаючи мутацію в коригувальних помилки генах гамет ДНК (mismatch repair genes). Мутація BRAF V600E при колоректальному раку зустрічається більш ніж в 90% випадків з усіх мутацій BRAF, а також є в 30-80% випадків спорадичного MSI-H колоректального раку. Ця мутація дуже рідко зустрічається в пухлинах, які пов'язані з синдромом Лінча. Мутація BRAF V600E тісно асоціюється зі спорадичними колоректального раками, для яких характерна MSI (нестабільність мікросателітів) через інактивації соматичної експресії протеїну MLH1. Якщо мутація BRAF V600E або метилювання промотора MLH1 констатується в разі пухлини MSI-H, то пухлина, швидше за все, спорадична, тому подальше тестування на підтвердження синдрому Лінча не потрібно.
2) Мутація BRAF - це незалежний ознака відповідної реакції на EGFR (рецептор фактора епідермального росту) у пацієнтів ингибиторного колоректального раку. Мутації BRAF створюють резистенцию на анти-епідермальний терапію фактора епідермального росту у пацієнтів з колоректальний рак, тому наявність мутацій BRAF - це важливий біомаркерів для прийняття рішення про правильну тактику лікування (застосування анти-EGFR медикаментів).
3) Визначення наявності мутацій BRAF може бути використано, щоб визначити тактику терапії для пацієнтів з меланомою. Мутації BRAF констатуються в 70% випадків первинної меланоми. Інгібітори кінази BRAF V600E доступні для терапії меланоми, але їх використання обмежене для пацієнтів з метастазами меланоми і доведеною мутацією BRAF V600E.
Рак грудей і яєчників
Рак грудей і яєчників пов'язаний з мутаціями в генах BRCA1 і BRCA2. У жінок, у яких є клінічно значуща мутація генів BRCA, ризик розвитку раку грудей і / або яєчників становить 80%. Мутації BRCA1 і BRCA2, відповідальні за рак, в генах зароджуються аутосомно-домінантним чином. Життєздатність раку грудей залежить від того, на якій стадії його ідентифікували, тому важлива і своєчасна ідентифікація мутацій.
Показання для генетичного тестування:
1) Тест проводять, якщо рак грудей або яєчників у пацієнтки маніфестує в ранньому віці.
2) Тест проводять пацієнткам, в сім'ях яких вже був констатований рак грудей або яєчників.
3) Тест проводять пацієнткам, у родичів яких вже доведена мутація зазначених генів.
4) Тест необхідно провести, якщо в анамнезі сім'ї констатовано випадки раку грудей або яєчників, ідентифіковані генетичні мутації або рак грудей констатовано у будь-якого з чоловіків в родині.
Предиспозицию до раку
Визначення схильності до раку важливо, щоб мати можливість діагностувати захворювання на ранніх стадіях і, можливо, уникнути його. Рання діагностика раку забезпечує своєчасний початок лікування, яке має вирішальне значення для того, щоб поліпшити життєздатність і відновлення. Різниця в довжині життя в залежності від того, чи поставлений діагноз раку на ранніх або пізніх стадіях, це головний аргумент, чому необхідно оцінити ймовірність розвитку раку.
Ідентифікація генетичної схильності до синдромів вродженого раку дозволяє почати реалізацію стратегії в області зниження ризиків, розрахувати ризик раку в сім'ї і визначити членів сім'ї, які знаходяться в зоні ризику.
У визначенні схильності до раку використовуються тести нового покоління на основі секвенування ДНК. Таким чином, проводиться одночасний аналіз кількох генів, які пов'язані з підвищеним ризиком розвитку раку.
Показання для генетичного тестування:
1) Тест проводять пацієнтам, у яких злоякісна пухлина маніфестує в ранньому віці.
2) Тест проводять пацієнтам з множинними первинними злоякісними пухлинами.
3) Тест проводять тим людям, у родичів яких констатовано злоякісна пухлина.
4) Тест проводять тим людям, анамнез сім'ї яких змушує думати про вроджену злоякісної пухлини, але генетичні зміни не констатовано раніше.
Сімейний аденоматозний поліпоз
(FAP - Familial Adenomatous Polyposis)
Сімейний аденоматозний поліпоз - це синдром предиспозиции до раку товстої кишки, при якому характерна поява сотень і тисяч аденоматозних поліпів по всій товстій кишці в ранньому віці. У віці 35 років у 95% пацієнтів сімейного аденоматозного поліпозу є поліпи. Якщо пацієнта з цим синдромом не лікують, колоректальний рак розвивається у віці 35-40 років. Поліпоз, пов'язаний з раком аденоматозних поліпів, успадковується аутосомно-домінантним чином.
Показання для аналізу цієї мутації:
1) Тест проводять пацієнтам, у яких констатовано аденоматозні поліпи.
2) Тест проводять людям, у родича першого ступеня якого констатовано це захворювання.
Синдром Лінча / Гередітарний неполіпозний колоректальний рак (HNPCC)
Синдром Лінча, який також відомий як гередітарний неполіпозний колоректальний рак (HNPCC), пов'язаний з підвищеним ризиком до раку товстої кишки та інших злоякісних пухлин (наприклад, ендометрія, рак яєчників, шлунка, тонкої кишки, гепатобіліарного дерева, верхніх сечових шляхів, мозку і шкіри ).
Синдром Лінча успадковується аутосомно-домінантним чином, пов'язаний з мутаціями в гаметах, а більш конкретно - в коригувальних генах ниток ДНК (гени MMR) - MLH1, MSH2 і MSH6 PMS2. Носії мутації протягом життя мають високий ризик розвитку будь-якого з перерахованих вище видів раку, але особливо високий ризик розвитку колоректального раку (80%) і ендометріального раку (20-60%). Типовим симптомом синдрому Лінча є його прояв в ранньому віці, тобто, діагноз встановлюється в середньому у віці близько 45 років.
Аналіз тканини пухлини проводиться у пацієнтів, у яких підтверджені критерії Амстердама II або Бетесда, щоб констатувати експресію протеїнів MMR за допомогою імуногістохімічного (ІГХ) аналізу і Микросателлитная нестабільність (MSI) ДНК.
Якщо експресія протеїнів MLH1 / PMS2 з ІГХ не знайдено, рекомендується аналіз метилування промоторів генів MLH1 і / або соматичне визначення мутації BRAF V600E, щоб виключити інші генетичні причини спорадического колоректального раку.
Якщо констатується пухлина з дефіцитом протеїнів MMR і виражена нестабільність мікросателітів ДНК, показаний подальший аналіз мутації гена MMR в периферичної крові і нормальних тканинах.
Показання для аналізу мутації:
1) Тест проводять пацієнтам, у яких виконуються критерії Амстердама II або Бетесда.
2) Тест проводять пацієнтам, в анамнезі сім'ї яких були випадки колоректального раку або раку, пов'язаного з синдромом Лінча.
3) Тест проводять пацієнтам, у яких високий ризик розвитку злоякісних раків, так як у родичів підтверджена яка-небудь із зазначених мутацій.
Нестабільність мікросателітів - MSI
Микросателлитная нестабільність є типом мутації, який виникає в разі колоректального раку. Ці мутації інактивують гени, які беруть участь в процесі корекції помилок ДНК (mismatch repair genes - MMR genes). Якщо в цих генах є дефекти, ДНК клітин накопичує соматичні мутації, в результаті чого клітини можуть стати злоякісними. Якщо ця мутація гена утворюється по лінії гамет, вони можуть бути передані наступному поколінню; такий механізм передачі характерний гередітарному неполіпозний раку (HNPCC). У сім'ях, в яких характерний колоректальний рак і підтверджені критерії Амстердама, приблизно в 90% випадків виявляється Микросателлитная нестабільність (MSI).
Поліпоз, пов'язаний з MUTYH (MAP)
Поліпоз, пов'язаний з MUTYH (MAP), є аутосомно-рецесивним захворюванням, яке характеризується появою різної кількості колоректальних аденом; ці аденоми мають високий ризик розвитку колоректального раку. MAP викликає біаллеліческіе мутації гена MUTYH в гаметах, але є повідомлення про те, що і у носіїв моноаллеліческой мутації є підвищений ризик розвитку колоректального раку. Клінічні симптоми MAP часто не відрізняються від сімейного аденоматозного поліпозу (FAP) або аттенуированного сімейного аденоматозного поліпозу (AFAP), які викликані мутаціями в гені аденоматозного поліпозу (APC), але в порівнянні з FAP, поліпоз, пов'язаний з MUTYH, більш виражений у літніх пацієнтів . Для представників білої раси характерні дві мутації, які відповідальні за 80% мутантних алелів в разі поліпозу, пов'язаного з MUTYH; це мутації p.Y179C і p.G396D (також відомі як Y165C і G382D).
Показання для генетичного обстеження:
1) Тест проводять клієнтам з клінічними симптомами, які схожі на FAP або AFAP, але у яких не фіксована мутація в гені APC;
2) В разі підтвердженої мутації тест проводять родичам першого ступеня пацієнта.
Дефіцит тіопурин-S-метилтрансфераза - TPMT
Такі медикаменти, що містять тіопурин, як 6-меркаптопурин і азатопрін, використовуються в якості хіміотерапевтичних засобів, а їх активні метаболіти мають і иммуносупрессивное і антипроліферативну дію.
Тіопурин-S-метилтрансфераза (TPMT) це ензим, який каталізує процес S -метілірованія в препаратах з вмістом тіопурин і бере участь в синтезі неактивних метаболітів. Є генетичні поліморфізм, які впливають на цей ферментний процес і можуть бути причиною токсичності цих медикаментів, які можуть бути небезпечні для життя. Токсичність кісткового мозку, викликана медикаментами, може виявитися як мієлосупресія, анемія, лейкопенія, інфекція або порушення згортання крові.
Показання для генетичного обстеження:
1) Тест проводять, щоб визначити активність ензиму TPMT і вибрати оптимальну дозу медикаментів перед початком терапії. Цей тест потрібно проводити тим пацієнтам, для яких передбачена терапія медикаментами з тіопурин.
секвенування екзома
Секвенування екзома включає в себе секвенування протеїно-кодують і доповнюють їх інтронових областей в близько 20 тисяч генів людського генома. Кодує район відображає приблизно 1-2% генома людини, але містять близько 85% хвороботворних мутацій. Секвенування екзома можна використовувати в якості ефективного інструменту для лікарів, щоб підтвердити діагноз пацієнта в дуже складних випадках, коли підтвердження не можна отримати за допомогою стандартного генетичного дослідження.
Показання для генетичного дослідження:
1) Тест проводиться для підтвердження клінічного діагнозу;
2) Тест проводиться, щоб встановити діагноз генетичного захворювання у пацієнтів, у яких це не представляється можливим за допомогою стандартних діагностичних панелей;
3) Тест проводиться з метою виявлення генів, що викликають хворобу.
