Голова розташована на довгій рухомий шиї і зазвичай може втягуватися під панцир цілком або частково, або укладатися під панциром набік. Дах черепної коробки не має скроневих ям і виличні дуг, тобто відноситься до анапсідному типу. Великі очниці розділені по середньої лінії тонкої межглазничного перегородкою. Ззаду в дах черепа вдається вушна вирізка.
У ротовій порожнині черепахи поміщається товстий м'ясистий мову.
Будова головного мозку і нервової системи черепах
Нервова система черепах типова для всіх хребетних, представлена спинним і головним мозком, який знаходиться всередині черепної коробки.
Головний мозок черепах розвинений дуже слабо і становить менше тисячної частки ваги тіла. Мозок 40 кг черепахи важить 3 грами. Спинний же мозок має значну товщину і вагу. У черепах 11 пар черепно-мозкових нервів, 12я пара - під'язикові нерви. Головний мозок складається з переднього, середнього, проміжного, довгастого мозку і мозочка.
Передній мозок представлений великими півкулями відходять від нього нюховими долями. Півкулі переднього мозку мають витягнуту форму з більш розширеним переднім кінцем. До передніх кінців півкуль у черепах прилягають нюхові цибулини. Дно переднього мозку складається в основному з смугастих тіл. Поверхня півкуль гладка, в мозковому зводі розрізняють стару кору (архіпалліум) і зачатки нової кори (неопалліум).
Проміжний мозок спереду прикритий переднім, а ззаду середнім мозком. У ньому знаходиться тім'яної орган, який служить реєструючим рецептором сезонних змін світлового режиму. На даху переднього мозку розташовується епіфіз. Тім'яної очей і парафиз у черепах відсутні. Ущільнений і прозорий передній відділ тім'яної органу нагадує кришталик ока, а його бокаловидная частина забезпечена пігментними і відчувають клітинами. На нижньому боці проміжного мозку є воронка, до якої прилягає гіпофіз і зорові нерви, що утворюють перехрест - хиазму.
До складу середнього мозку входять дві зорові частки. Частки відносно невеликі і майже повністю відкриті. Середній мозок частково прикритий півкулями.
Мозочок розвивається в вигляді напівкруглої складки (має форму вертикальної пластинки з сильно потовщеною верхньою частиною), яка прикриває передню частину довгастого мозку. Мозочок у рептилій великий, що відповідає за хорошу координацію рухів.
Довгастий мозок відповідає за безумовно-рефлекторні рухову активність і основні вегетативні функції - дихання, кровообіг, травлення та ін. Він є продовженням спинного мозку. Довгастий мозок зігнутий у вертикальній площині, є продовженням спинного мозку. У черепах вузький довгастий мозок вузький, але ромбовидна ямка, яка є порожниною четвертого шлуночка, досить широка.
Спинний мозок має типову будову: сіра речовина (тіла нейронів) розташовується в центральній частині і має форму метелики, біла речовина (відростки нейронів) розташовується навколо сірого.
