Праця за кордоном. Частина 6. Три історії російських вчених

Я вчилася в Москві, у французькій школі, і хотіла займатися чимось, пов'язаним одночасно і з біологією, і з математикою. Правда, я думала, що нічого такого в природі не існує, і тому вступила на мехмат МГУ. Моєю спеціальністю була теорія ймовірності і фінансова математика - тобто все, що пов'язано з ринками і з опціонами (більшість людей з моєї групи працюють зараз в банках або страхових компаніях).

На п'ятому курсі я брала участь в проекті, який був пов'язаний з поширенням по світу людей з Африки: як вони вийшли звідти і які у них були шляхи міграції. Ми дивилися на геноми різних африканських племен, французів, італійців, росіян, уйгурів, китайців, індійців, американських аборигенів, кластерізованний їх і вираховували їх шлях. А інший проект, яким я займалася, був пов'язаний з ДНК, і робила я його в лабораторії Всеволода Макєєва з ДержНДІ генетики. У підсумку я пішла туди в аспірантуру і три роки займалася вивченням ДНК. Це була така суто теоретична біоінформатика: ми просто вивчали повторювані мотиви в геномі. Мені хотілося чогось більш прикладного, і так вийшло, що я поступово почала займатися раком.

Сталося це в такий спосіб. Будучи в аспірантурі, я брала участь в російсько-французькому проекті і два місяці на рік повинна була проводити у Франції. Скажу чесно, Франція мені дуже не подобалася. По-перше, коли я приїжджала на стаж, умови були досить важкі: у мене не було житла і я нікого там не знала. Загалом, я багато працювала, ні з ким не спілкувалася, і Париж мені здавався не найприємнішим місцем. Але потім я познайомилася зі своїм майбутнім чоловіком, стала приїжджати частіше в Париж, і коли аспірантура закінчилася, я подумала: чому б не поїхати на постдок туди. На той час я прочитала про рак досить багато біологічної літератури. Мені стало цікаво, що має статися з кліткою, щоб вона стала раковою, як повинні перебудуватися її геном, порушитися регуляція клітинних процесів і метаболізм. У підсумку я знайшла лабораторію біоінформатики в Інституті Кюрі, що спеціалізується на ракових дослідженнях, і почала робити з ними спільний проект. А потім вони покликали мене працювати до них на постдок.

Біоінформатика - це область науки, що вивчає, як аналізувати складні біологічні дані. У лабораторії, де я працюю, ми отримуємо дані про можливості мутацій ДНК ракової клітини на певних позиціях в геномі, після чого ці дані можна прив'язати до клінічного прогнозу, щоб зрозуміти, чи буде рак агресивним і який спосіб лікування буде (або не буде) працювати для цього пацієнта.

Я працюю не з самими клітинами, а з даними, які біологи отримують, використовуючи ракові клітини пацієнта. Мені цікава механіка: чому рак виникає? Чому один рак буде більш агресивний, ніж інший? Адже що таке рак? Рак - це в тому числі освіту в клітці мутацій, які не дають їй вчинити самогубство. Коли звичайної, неракові клітці потрібно вбити себе, вона запускає механізм під назвою апоптоз. Взагалі, від 50 до 70 мільярдів наших клітин кінчають життя самогубством кожен день. Наприклад, ми загоряємо на сонці, і ультрафіолет порушує ДНК всередині клітин. Клітка намагається відновити ДНК і не може: занадто багато пошкоджень. Тоді починається апоптоз, і шкіра сходить. Ракові ж клітини не хочуть вмирати, вони хочуть жити вічно, тому накопичують мутації в шляхах передачі сигналу, які ведуть до апоптозу. Білок, який допомагає клітині вбити себе, вже не може виконувати свою функцію, і тоді клітина продовжує жити. Паралельно вона накопичує мутації, які дозволяють їй швидко ділитися, швидше інших клітин. Ракові клітини сприяють також утворення всередині пухлини нових кровоносних судин, які постачають ракову тканину глюкозою. Крім того, ракові клітини можуть придбати здатність відірватися від місця, де вони виникли, і, переміщаючись по судинах, колонізувати інші місця в організмі. І це вже метастази.

Я працюю над раком, який називається нейробластома, - він буває у дітей. Середній вік виникнення нейробластоми - 18 місяців. Деякі діти народжуються з цим раком, і буває, що первинний рак і навіть його метастази раптово зникають - без будь-якого лікування. Як не дивно, це залежить від віку: найчастіше, коли дитина народжується з нейробластомою, навіть якщо є метастази, його не лікують, а спостерігають, тому що велика ймовірність, що пухлина зникне сама. Якщо ж діагноз був поставлений, коли дитині більше двох років, нейробластома, швидше за все, буде агресивною. Поки не дуже зрозуміло, чому вік настільки впливає на те, агресивним буде рак чи ні. Це як раз мета моєї роботи: я розробляю методи аналізу даних по мутацій і намагаюся проасоціювати ці мутації з тривалістю життя ракових хворих.

Паралельно я співпрацюю з одним бельгійським стартапом, який присвячений методам діагностики раку. Ми дивимося тільки на геномної профіль і по ньому визначаємо, які ліки має працювати. Ця компанія пропонує профілювання ракового генома: будь-раковий хворий може зробити геномної профіль свого раку і дізнатися, можливо таргетной лікувати його чи ні.

Інший проект, яким я займаюся для тієї ж компанії, - моніторинг ракових клітин і мутацій в крові пацієнта. Ракові клітини виділяють свою ДНК в кров. Буквально рік чи півтора тому вчені навчилися отримувати цю ДНК з крові, щоб дивитися, чи є в ній мутації, які можна таргетной лікувати. Точно так же кожні три місяці можна брати на аналіз кров у пацієнта, вилікували від раку, і перевіряти, чи не з'явилася там ДНК з мутаціями, які характерні для ракових клітин. Таким чином можна буде дізнатися, чи повернувся рак, без сканування всього тіла, а просто за допомогою аналізу крові. Я працюю над комп'ютерним алгоритмом, який допоможе аналізувати дані крові і визначати наявність цих мутацій, навіть якщо відсоток такої ДНК з мутаціями вкрай малий.

Проблеми, які я вирішую, мені цікаві як головоломка. Це такий челендж - зробити щось, до чого інші люди ще не додумалися.

Спочатку я дуже сумувала за Москві, мені здавалося, що тут нудно, немає цікавих людей, не вистачає стресу і метушні, немає можливостей, які є в Москві. А потім я поступово звикла і мені стало подобатися, що стресу немає і все спокійно. У мене з'явилося багато друзів: всі вони російські або іноземці, які приїхали до Франції. Хоча я вже 7 років в Парижі і у мене є знайомі французи, друзів серед них у мене немає. Більше я по Москві не сумую і не можу сказати, що мені хочеться туди повернутися.

Зараз у мене позиція інженера. Якщо ж я отримаю дослідницьку позицію в Парижі, то, напевно, залишуся тут ще на п'ять років. Якщо зможу знайти хорошу позицію в Лондоні або в США, переїду туди.

Правда, в Лондоні зараз скорочують гроші на науку, і там не так просто отримати позицію. Читати далі >>

Читати далі